MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfomonile tiedjei DSM 6799 chromosome

Total Repeats: 91459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018025	CAT	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408410
2	NC_018025	GAA	2	6	111	116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408410
3	NC_018025	CTGT	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	392408410
4	NC_018025	T	7	7	155	161	0 %	100 %	0 %	0 %	392408410
5	NC_018025	AGC	2	6	215	220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408410
6	NC_018025	CGG	2	6	476	481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392408410
7	NC_018025	CTCAT	2	10	499	508	20 %	40 %	0 %	40 %	392408410
8	NC_018025	GAA	2	6	573	578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408410
9	NC_018025	ACGA	2	8	582	589	50 %	0 %	25 %	25 %	392408410
10	NC_018025	TCGA	2	8	610	617	25 %	25 %	25 %	25 %	392408410
11	NC_018025	TGC	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408410
12	NC_018025	GAC	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408410
13	NC_018025	AG	3	6	692	697	50 %	0 %	50 %	0 %	392408410
14	NC_018025	T	6	6	711	716	0 %	100 %	0 %	0 %	392408410
15	NC_018025	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408410
16	NC_018025	ACCG	2	8	1066	1073	25 %	0 %	25 %	50 %	392408410
17	NC_018025	AGAA	2	8	1074	1081	75 %	0 %	25 %	0 %	392408410
18	NC_018025	TGA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408410
19	NC_018025	CTG	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408410
20	NC_018025	AGA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408410
21	NC_018025	CGG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392408410
22	NC_018025	TCAT	2	8	1273	1280	25 %	50 %	0 %	25 %	392408410
23	NC_018025	A	7	7	1297	1303	100 %	0 %	0 %	0 %	392408410
24	NC_018025	CT	3	6	1319	1324	0 %	50 %	0 %	50 %	392408410
25	NC_018025	TGT	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392408411
26	NC_018025	T	6	6	1719	1724	0 %	100 %	0 %	0 %	392408411
27	NC_018025	A	6	6	1756	1761	100 %	0 %	0 %	0 %	392408411
28	NC_018025	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408411
29	NC_018025	ATG	2	6	1854	1859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408411
30	NC_018025	AAGG	2	8	1878	1885	50 %	0 %	50 %	0 %	392408411
31	NC_018025	GAT	2	6	1886	1891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408411
32	NC_018025	A	7	7	1905	1911	100 %	0 %	0 %	0 %	392408411
33	NC_018025	GATG	2	8	2018	2025	25 %	25 %	50 %	0 %	392408411
34	NC_018025	GGA	2	6	2054	2059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408411
35	NC_018025	CTT	2	6	2122	2127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408411
36	NC_018025	ACG	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408411
37	NC_018025	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408411
38	NC_018025	AGA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408411
39	NC_018025	GAA	2	6	2345	2350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408411
40	NC_018025	CCT	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408411
41	NC_018025	AGA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408411
42	NC_018025	GAG	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408411
43	NC_018025	TC	3	6	2694	2699	0 %	50 %	0 %	50 %	392408411
44	NC_018025	AAC	3	9	2904	2912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408412
45	NC_018025	TCA	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408412
46	NC_018025	GTT	2	6	3038	3043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392408412
47	NC_018025	GTCA	2	8	3112	3119	25 %	25 %	25 %	25 %	392408412
48	NC_018025	TCCG	2	8	3160	3167	0 %	25 %	25 %	50 %	392408412
49	NC_018025	AGT	2	6	3187	3192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408412
50	NC_018025	TGC	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408412
51	NC_018025	G	6	6	3212	3217	0 %	0 %	100 %	0 %	392408412
52	NC_018025	GGA	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408412
53	NC_018025	GGC	2	6	3320	3325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392408412
54	NC_018025	A	7	7	3355	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	392408412
55	NC_018025	AAT	2	6	3574	3579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392408412
56	NC_018025	ATGG	2	8	3617	3624	25 %	25 %	50 %	0 %	392408412
57	NC_018025	TAT	2	6	3637	3642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392408412
58	NC_018025	ACG	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408412
59	NC_018025	AAT	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392408412
60	NC_018025	AC	3	6	3749	3754	50 %	0 %	0 %	50 %	392408412
61	NC_018025	A	6	6	3820	3825	100 %	0 %	0 %	0 %	392408412
62	NC_018025	GGA	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408412
63	NC_018025	GGC	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392408412
64	NC_018025	CGGC	2	8	4197	4204	0 %	0 %	50 %	50 %	392408412
65	NC_018025	GAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408412
66	NC_018025	GAA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408412
67	NC_018025	ATC	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408412
68	NC_018025	TGGA	2	8	4419	4426	25 %	25 %	50 %	0 %	392408412
69	NC_018025	CTTT	2	8	4452	4459	0 %	75 %	0 %	25 %	392408412
70	NC_018025	A	6	6	4617	4622	100 %	0 %	0 %	0 %	392408412
71	NC_018025	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408412
72	NC_018025	GA	3	6	4747	4752	50 %	0 %	50 %	0 %	392408412
73	NC_018025	GAA	3	9	4877	4885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408412
74	NC_018025	TAC	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408412
75	NC_018025	CAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408412
76	NC_018025	C	6	6	5021	5026	0 %	0 %	0 %	100 %	392408412
77	NC_018025	GAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408412
78	NC_018025	ACC	2	6	5171	5176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408412
79	NC_018025	TTC	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408412
80	NC_018025	T	6	6	5241	5246	0 %	100 %	0 %	0 %	392408412
81	NC_018025	ATT	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392408412
82	NC_018025	CCA	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408413
83	NC_018025	TTC	2	6	5719	5724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408413
84	NC_018025	GGTTT	2	10	5750	5759	0 %	60 %	40 %	0 %	392408413
85	NC_018025	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392408413
86	NC_018025	CCG	3	9	5882	5890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392408413
87	NC_018025	AGA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408413
88	NC_018025	CTG	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408413
89	NC_018025	ATCC	2	8	5966	5973	25 %	25 %	0 %	50 %	392408413
90	NC_018025	TCTAT	2	10	6014	6023	20 %	60 %	0 %	20 %	392408413
91	NC_018025	AGT	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408413
92	NC_018025	ATC	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408413
93	NC_018025	GTT	2	6	6148	6153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392408413
94	NC_018025	GAC	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408413
95	NC_018025	CAC	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408414
96	NC_018025	CAA	2	6	6620	6625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408414
97	NC_018025	AAT	2	6	6630	6635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392408414
98	NC_018025	CGC	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392408414
99	NC_018025	TAG	2	6	6728	6733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408414
100	NC_018025	ATG	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408414
101	NC_018025	CATC	2	8	6882	6889	25 %	25 %	0 %	50 %	392408414
102	NC_018025	CATG	2	8	6893	6900	25 %	25 %	25 %	25 %	392408414
103	NC_018025	ATG	3	9	7060	7068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408414
104	NC_018025	TC	3	6	7108	7113	0 %	50 %	0 %	50 %	392408414
105	NC_018025	ATC	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408415
106	NC_018025	CCA	3	9	7690	7698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408415
107	NC_018025	AC	3	6	7734	7739	50 %	0 %	0 %	50 %	392408415
108	NC_018025	TTC	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408415
109	NC_018025	GAG	2	6	7913	7918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408415
110	NC_018025	TTG	3	9	8062	8070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392408415
111	NC_018025	CCTG	2	8	8180	8187	0 %	25 %	25 %	50 %	392408415
112	NC_018025	GCA	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408415
113	NC_018025	CCT	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408415
114	NC_018025	TTC	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408415
115	NC_018025	TTC	2	6	8328	8333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408415
116	NC_018025	TCT	2	6	8351	8356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408415
117	NC_018025	GTTC	2	8	8389	8396	0 %	50 %	25 %	25 %	392408416
118	NC_018025	GT	3	6	8435	8440	0 %	50 %	50 %	0 %	392408416
119	NC_018025	AAC	2	6	8469	8474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408416
120	NC_018025	CTG	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408416
121	NC_018025	TTTG	2	8	8531	8538	0 %	75 %	25 %	0 %	392408416
122	NC_018025	GGCAC	2	10	8559	8568	20 %	0 %	40 %	40 %	392408416
123	NC_018025	CCA	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408416
124	NC_018025	CTTTCT	2	12	8826	8837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408417
125	NC_018025	GAT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408417
126	NC_018025	GAT	2	6	9060	9065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408417
127	NC_018025	AAT	2	6	9135	9140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392408417
128	NC_018025	CCA	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408417
129	NC_018025	ATTG	2	8	9247	9254	25 %	50 %	25 %	0 %	392408417
130	NC_018025	TGA	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408417
131	NC_018025	CGT	2	6	9302	9307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408417
132	NC_018025	CTT	2	6	9339	9344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408417
133	NC_018025	CTT	2	6	9393	9398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408417
134	NC_018025	GCCA	2	8	9428	9435	25 %	0 %	25 %	50 %	392408417
135	NC_018025	TCG	2	6	9462	9467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408417
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137	NC_018025	ACA	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408417
138	NC_018025	CAG	2	6	9496	9501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408417
139	NC_018025	CA	3	6	9519	9524	50 %	0 %	0 %	50 %	392408417
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143	NC_018025	ATC	2	6	9755	9760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408418
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248	NC_018025	AGG	2	6	17286	17291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408426
249	NC_018025	ACC	2	6	17299	17304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408426
250	NC_018025	ATC	2	6	17326	17331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408426
251	NC_018025	CAA	2	6	17364	17369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408426
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254	NC_018025	T	7	7	17521	17527	0 %	100 %	0 %	0 %	392408426
255	NC_018025	AT	3	6	17611	17616	50 %	50 %	0 %	0 %	392408426
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258	NC_018025	TCC	2	6	17785	17790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408426
259	NC_018025	ACA	2	6	17863	17868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408426
260	NC_018025	T	6	6	17892	17897	0 %	100 %	0 %	0 %	392408426
261	NC_018025	CTT	2	6	17898	17903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408426
262	NC_018025	GCA	2	6	17947	17952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408426
263	NC_018025	CGAA	2	8	17993	18000	50 %	0 %	25 %	25 %	392408426
264	NC_018025	CAC	2	6	18027	18032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392408426
265	NC_018025	TCG	2	6	18093	18098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392408426
266	NC_018025	AAT	2	6	18184	18189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392408426
267	NC_018025	CGA	2	6	18217	18222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408426
268	NC_018025	CTT	2	6	18311	18316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408426
269	NC_018025	TC	3	6	18389	18394	0 %	50 %	0 %	50 %	392408426
270	NC_018025	GAT	2	6	18428	18433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408426
271	NC_018025	TACA	2	8	18456	18463	50 %	25 %	0 %	25 %	392408426
272	NC_018025	AATCC	2	10	18536	18545	40 %	20 %	0 %	40 %	392408426
273	NC_018025	AAC	2	6	18585	18590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408426
274	NC_018025	GCC	2	6	18603	18608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392408426
275	NC_018025	GGC	2	6	18631	18636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392408426
276	NC_018025	GTCG	2	8	18645	18652	0 %	25 %	50 %	25 %	392408426
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278	NC_018025	TTG	2	6	18670	18675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392408426
279	NC_018025	GAA	2	6	18689	18694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408426
280	NC_018025	CCT	2	6	18757	18762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408426
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289	NC_018025	GGA	2	6	19642	19647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408427
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291	NC_018025	AGC	2	6	19688	19693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408427
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293	NC_018025	GGAA	2	8	19711	19718	50 %	0 %	50 %	0 %	392408427
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299	NC_018025	A	6	6	20293	20298	100 %	0 %	0 %	0 %	392408428
300	NC_018025	ATGA	2	8	20330	20337	50 %	25 %	25 %	0 %	392408428
301	NC_018025	CTC	2	6	20339	20344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408429
302	NC_018025	A	6	6	20354	20359	100 %	0 %	0 %	0 %	392408429
303	NC_018025	TACTCG	2	12	20425	20436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392408429
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338	NC_018025	TTAATA	2	12	23848	23859	50 %	50 %	0 %	0 %	392408432
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355	NC_018025	ACT	2	6	25443	25448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408433
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369	NC_018025	A	6	6	26293	26298	100 %	0 %	0 %	0 %	392408433
370	NC_018025	ATC	2	6	26493	26498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392408433
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372	NC_018025	GAAT	2	8	26656	26663	50 %	25 %	25 %	0 %	392408434
373	NC_018025	GAG	2	6	26716	26721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408434
374	NC_018025	TCC	2	6	26725	26730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408434
375	NC_018025	ACCGAG	2	12	26803	26814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408434
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377	NC_018025	AGG	2	6	26920	26925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392408434
378	NC_018025	AGC	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392408434
379	NC_018025	GTCG	2	8	27063	27070	0 %	25 %	50 %	25 %	392408434
380	NC_018025	TCC	2	6	27092	27097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408434
381	NC_018025	GACA	2	8	27124	27131	50 %	0 %	25 %	25 %	392408434
382	NC_018025	CTT	2	6	27268	27273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392408434
383	NC_018025	AT	3	6	27275	27280	50 %	50 %	0 %	0 %	392408434
384	NC_018025	CAA	2	6	27360	27365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392408435
385	NC_018025	CGGCG	2	10	27380	27389	0 %	0 %	60 %	40 %	392408435
386	NC_018025	A	7	7	27402	27408	100 %	0 %	0 %	0 %	392408435
387	NC_018025	TGA	2	6	27450	27455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392408435
388	NC_018025	AGA	2	6	27470	27475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392408435
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390	NC_018025	TCC	2	6	27616	27621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392408435
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